但水刀切割机特点受到其数控操作软件的影响，必须准确操作水刀切割机的控制软件，才能确保切割质量、切割效率以及切割成本等都符合上述特点。接下来要讲述的就是水刀切割机软件的一些常规性功能。

     操作水刀切割机软件的时候，如果选中单段，那就就要从头仿真或从任意段仿真，每按一次键盘，仿真NC代码中一行；如果是曲线的话，那么这整个曲线一次仿真；如果未选中，则仿真时是连续仿真模式。

     如果要显示程序的话，仿真过程会显示每一段加工代码，但显示代码会使仿真速度变慢。X轴镜像代表的是将NC代码以X轴为基准进行镜像，也已是NC代码中Y值由原来的正值变负值，原来的负值变正值。而Y轴镜像也是如此。

    水刀切割机操控软件中还有一项DXF自动排序，如果选中此选项，控制软件将对DXF文件中图形自动串联。也就是从段开始，自动依次寻找与它相连的下一段。

     由于一个封闭图形中常常有进刀线和出刀线，为便于自动串接需先保存进刀线，再点取封闭图形中条线，之后再去选择封闭图形中其它所有线，选择出刀线。